MissingInputException

Bonjour ! :)

Lorsque je lance le pipeline j'ai l'erreur suivante :

Building DAG of jobs... MissingInputException in line 26 of /some/where/chipflow/workflow/rules/cutadapt.rules: Missing input files for rule cutadapt: input/H3K27me3_8h_Rep2_R1.fastq.gz

Dans config/design.txt j'ai :

IP_NAME INPUT_NAME      NB_IP   NB_INPUT
H3K27ac_8h      INPUT_8h        2       1
H3K27ac_15h     INPUT_15h       2       1
H3K27ac_36h     INPUT_36h       2       1
H3K27me3_8h     INPUT_8h        1       1
H3K27me3_15h    INPUT_15h       2       1
H3K27me3_36h    INPUT_36h       2       1
H3K4me3_8h      INPUT_8h        2       1
H3K4me3_15h     INPUT_15h       2       1
K4me3_36h       INPUT_36h       2       1

NB_IP pour H3K27me3_8h est 1 (!). C'est bien le seul échantillon pour lequel je n'ai qu'un seul fichier.

Je ne suis pas sûr s'il s'agit là d'un problème dans mon design ou d'une erreur dans cutadapt.rules.

D’après ce que je vois dans le Snakefile (à partir de la ligne 193) le cas NB_IP == 1 et NB_INPUT == 1 n'est pas prévu.... (?)

Merci pour votre aide.

V.