Cet outil a été initialement développé par [Laurent Knoll](https://github.com/verdi8) dans le cadre du projet de science participative [Derrière le blob, la recherche](https://www.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/le-blob-et-la-demarche-scientifique) du CNRS. Les sources originales sur [GitHub](https://github.com/verdi8/blob-analysis-lab-demo).
Ce site est une ***adaptation*** de l'outil pour des séances en école élémentaire, avec la possibilité notamment d'utiliser des tablettes tactiles et d'obtenir facilement des mesures simples sur la croissance du blob (périmètre et aire).
# Mode opératoire
## Présentation
**Cet outil vous accompagne** - pas à pas - dans **l'analyse des photos de blobs**, afin de fournir les données nécessaires à l'apprentissage du _Machine Learning_.
...
...
@@ -7,9 +12,9 @@ L'analyse se déroule en **5 étapes** :
[1. Charger une photo](#Étape-1-charger-une-photo)<br>
[2. Positionner la règle](#Étape-2-positioner-la-règle)<br>
[3. Positionner la boîte de Petri](#Étape-3-positionner-la-boîte-de-petri)<br>
[4. Détourer le blob à main levée](#Étape-4-détourer-le-blob)<br>
[5. Télécharger les fichiers de mesures](#Étape-5-télécharger-les-résultats)<br>
[5'. Fusionner les .csv ](#Étape-539-fusionner-les-csv)
[4. Détourer le blob à main levée](#Étape-4-détourer-le-blob)<br>
[5. Voir les résultats de mesures](#Étape-5-voir-les-résultats)<br>
[6. Télécharger les fichiers de mesures](#Étape-6-optionnel-télécharger-les-résultats)<br>
Chaque étape est décrite dans la partie droite du _lab_. Il est possible de revenir à tout moment
en arrière en cliquant sur le titre de l'étape.
...
...
@@ -46,16 +51,16 @@ Maintenant au travail !
## Étape 2 : positioner la règle
Cette étape permet au logiciel de déterminer l'échelle de la photo.
**Déplacer la ligne jaune à l'aide des 2 "poignées"** (petits carrés blancs) à chacune de ses extrémités afin de
**couvrir 10cm de la règle**.
**Déplacer la ligne jaune à l'aide des 2 "poignées"** (petits carrés blancs sur ordinateur *ou* des ronds sur tablette) à chacune de ses extrémités afin de
**couvrir 8cm de la règle**.

Pour s'assurer que 10 centimètres sont bien couverts, **les petits points "détrompeurs" doivent tomber sur chaque centimètre**.
Pour s'assurer que 8 centimètres sont bien couverts, **les petits points "détrompeurs" doivent tomber sur chaque centimètre**.

Si il y a moins de 10cm règle sur la photo, il est possible de modifier la taille à couvrir avec les boutons +/- (en bleu ci-dessous).
Si il y a moins de 8cm règle sur la photo, il est possible de modifier la taille à couvrir avec les boutons +/- (en bleu ci-dessous).
Le nombre de détrompeurs sera ajusté.
Pour placer la règle avec plus de précision, utiliser le bouton (en jaune ci-dessous).
...
...
@@ -94,7 +99,6 @@ Lors de cette étape, **entourer d'une ligne jaune le blob** (dessiner en mainte
> Il est possible de revenir en arrière sur les derniers points du tracé avec le bouton 
...
...
@@ -109,40 +113,25 @@ Lorsque l'on a rejoint le point de départ marqué par un carré blanc, **le con
Le bouton  s'active et permet de **passer à l'étape suivante**.
---
## Étape 5 : voir les résultats
## Étape 5 : télécharger les résultats


**Télécharger les fichiers un à un** avec .
Les fichiers sont stockés dans le répertoire "Téléchargements" du navigateur.
> [!NOTE|label:Attention]
> Ces fichiers ne peuvent pas être tout de suite déposés sur l'espace de dépôt des fichiers d'analyse (https://blob.cnrs.fr/).
>
> En effet, le fichier _.csv_ généré ne contient que les mesures (aire, périmètre, circualirité, etc.) que pour la photo qui vient d'être analysée.
> Le nom du fichier contient le numéro du blob (par exemple: Results_ConJ1Ex*B3*.csv).
>
> L'espace de dépôt des analyses n'attend qu'**un seul fichier** _.csv_ **pour toutes** les photos d'une séquence groupe/jour/expérience (par ex.: Results_ConJ1Ex.csv).
>
> Une étape supplémentaire permet de regrouper les fichiers.
## Étape 5' : fusionner les .csv
Les ***mesures du périmètre et de l'aire*** du blob détouré s'affiche alors. Les élèves peuvent alors les noter.
Le bouton ***Plus de résultats*** permet d'afficher les fichiers d'analyse à télécharger si on veut aller plus loin.
---
> :gift: Pour 5 étapes effectuées une étape offerte !
## Étape 6 (optionnel): télécharger les résultats
Un bouton dans l'étape 5 permet d'ouvrir l'outil de fusion des fichiers.


**Télécharger les fichiers un à un** avec .
Une fenêtre comme celle-ci s'affiche :
Les fichiers sont stockés dans le répertoire "Téléchargements" du navigateur.

Pas à pas :
1.\[encadré en vert] Sélectionner des fichiers à fusionner. Plusieurs fichiers peuvent être sélectionnés à la fois. Ils peuvent être sélectionnés en vrac mêmes s'ils font partie de séquences (groupe/jour/expérience) d'analyse différentes.
2.\[marqué en rouge] Les fichiers sont automatiquement triés et regroupés par séquence (groupe/jour/expérience)
3.\[entouré en jaune] Les fichiers résultats sont téléchargeables avec le bouton 
Maintenant **les fichiers peuvent être transmis par [la plateforme de dépôt de données](https://blob.cnrs.fr/)**.